對金拍屋有興趣的投資人，如果需要向銀行貸款，可得先把「代墊款利率」搞清楚。代墊款利率是指房屋還未完成過戶，房屋所有權不在貸款人身上，這段期間銀行提供的房貸利率會比一般房貸高，約4%起跳，等房屋所有權移轉到貸款人身上，房貸利率才會降至正常水準。
目前多數銀行都提供法拍、金拍屋的貸款業務，不過由於過去兩、三年不動產景氣回春，法拍市場反向萎縮，針對拍賣屋推出貸款專案的業者僅剩合庫商銀、聯邦銀等，之前法拍貸款龍頭新竹商銀在被渣打銀行合併後，雖然現在仍可辦理拍賣屋貸款，但已經不是房貸業務的主流商品。
台灣金服指出，民眾參加法拍屋或金拍屋的投標，都需先繳付投標金額兩成的保證金，如果順利得標，剩下八成的尾款必須在拍定後七個營業日內補足。
若資金不夠一時無法付清，可以向銀行辦理一至三個月期限不等的尾款代墊，由於對銀行來說，這部分貸款屬信用貸款，所以利率較高；等房地完成過戶設定後，對銀行來說為擔保放款，因此利率較低。
在貸款利率上，目前合庫商銀提供的代墊款利率在4.15%~5.15%之間，期間最長三個月，房屋所有權移轉登記後的房貸利率回歸一般房貸，為2.60%~5.26%；聯邦銀利率較高在6.3%~7.41%間，最長僅能兩個月。